Çeşitli arazi ve ekosistemleri nedeniyle Peru, puma, jaguar, gözlüklü ayılar, sarı kuyruklu yünlü maymunlar, lama, alpaka ve kazası dahil olmak üzere 500 tür memeliye ev sahipliği yapmaktadır. memelilere göre Peru'da 1800 kuş türü ve 300 sürüngen türü vardır.
Peru’daki 500 memeli türünden 70’i endemik ve neredeyse 100’ü tehdit veya tehlike altında. Nadir endemik türler arasında jaguar, gözlüklü ayı ve sarı kuyruklu yünlü maymun vardır.
Peru'nun yağmur ormanı, başka hiçbir yerde bulunmayan nadir görülen kuş, sürüngen ve memeli hayvan türlerine ev sahipliği yapan Amazon yağmur ormanının bir parçasıdır. Peru'nun Pasifik kıyılarında, pek çok tür kuru çöl iklimi içinde yaşamaya adapte olmuşlardır. Pasifik kıyı suları, Humboldt pengueni dahil olmak üzere geniş balık ve deniz kuşu yaşamını destekler. Peru da dağlar için bilinir. Bu dağlar lalalar, alpakalar ve hazineler için gıda görevi gören birçok ot ve bitkinin büyümesini destekler. Peru'da yaşayan memeliler yüksek irtifalarda yaşamaya adapte olmuşlardır.
2007 yılında, bilim adamları Peru'da yeni bir bulut-orman kemirgen türü keşfetti. Dikenli sıçan ile yakından ilgilidir. 2014 itibariyle, bilim adamları Peru'nun çeşitli ekosistemlerinde yeni türler keşfetmeye devam ediyor.