Maine'deki başlıca su kütleleri nehirleri, gölleri ve okyanusu içerir. Maine, Atlantik Okyanusu sınırındaki en az 230 mil sahil şeridine sahiptir. Maine Körfezi, Cape Cod, Mass. Ve Nova Scotia, Kanada arasındaki Atlantik Okyanusu bölgesidir.
Maine’deki Moosehead Gölü eyaletteki en büyük göldür. Aynı zamanda tamamen New England eyaletlerinde bulunan en büyük göldür. Kennebec Nehri Moosehead Gölü'nde başlar ve Maine Körfezi'nde sona ermeden önce yaklaşık 150 mil güneye doğru gider. Androscoggin Nehri Maine'e New Hampshire'dan girer ve Kennebec Nehri'ne katılmadan önce yaklaşık 175 mil akar. Penobscot Nehri ve birkaç kolu içeren Penobscot Nehri sistemi, Maine'deki en uzun nehir sistemidir. Yaklaşık 350 mil uzunluğunda. St. John Nehri Maine'i Kanada'dan ayıran sınırın bir parçasıdır. St. John Nehri'nin yaklaşık 210 mil uzağında eyalet sınır vardır.
Diğer birçok göl Maine'de bulunur. Başlıca göller Franklin County'deki Rangeley Gölü, Büyük Gölet ve Kennebec İlçesindeki Cobbosseecontee Gölü, Oxford İlçesindeki Richardson Gölleri ve Cumberland İlçesindeki Sebago Gölü'dür. Maine’de binlerce daha küçük göl ve nehir var.
