Kiraz ağaçları çok sığ bir kök sistemine sahiptir. Birkaç ağaç çok derin kök sistemlere sahip olurken, çoğunda yalnızca 12 ila 16 inç derinlikte büyüyen kökler vardır - ve kiraz ağaç kökleri genellikle bu kadar derin büyümez.
Kiraz ağacının kökleri iki ana işleve sahiptir. Büyük kökler ağacı zemine tutturur ve besinleri ve suyu ağacın geri kalanına taşır. Küçük besleyici kökler, besinleri ve suyu topraktan çeker ve daha sonra büyük köklere gönderir. Bu daha büyük kökler diğer ağaçlardan daha sığ ve dik olduğundan, beton ve peyzajda hasara neden olabilirler. Sığ kökleri nedeniyle bol bol yer vişne ağaçları dikmek en iyisidir.
