Kasım 2015 itibariyle, Johnny Mathis hiç evlenmedi. Mathis, istemeden kendisinin, eşcinsel yaşam tarzına alıştığını belirttiği Us dergisinin 1982 röportajında kendisini eşcinsel olarak tanımladı .
Mathis'in Us Magazine dergisindeki röportajındaki yorumları tartışmalıydı ve Mathis, pek çok taraftarı cinsel yöneliminden emin olmayan ifadelerini açıklığa kavuşturmayı reddetti. Mathis, 2006'daki bir podcast röportajında eşcinselliğini resmi olarak kabul etti ve ifadelerini netleştirmek konusundaki isteksizliğinin makaleye yanıt olarak aldığı ölüm tehditlerinden kaynaklandığını belirtti. Mathis ayrıca cinsel yönelimini kabul etmedeki isteksizliğinin kısmen neslinin sosyal normlarından kaynaklandığını da itiraf etti.
