Hem doğal inciler hem de kültür incileri gerçek olsa da, yaratılışları aralarındaki en büyük farktır. Doğal inciler, istiridye ve istiridyelerde meydana gelir, tahriş edici, bir kum tanesi gibi, yaratıkların kabukları içine girdiğinde. Koruma için, çift kabuklu bir kalsiyum karbonat formu olan sedef ile kaplanır. Sedef istiridye istiridye korur ve zamanla katmanları oluşturur, kabuk içinde doğal bir inci oluşturur.
İnci çiftçileri kasıtlı olarak küçük boncuklar veya yuvarlak istiridye kabukları parçaları olan incileri, incilerin oluşumunu zorlamak için istiridye kabukları bivalflarına yerleştirir. Yetiştirme süreci, pazar değerinde bir inci üretmek için bir ila iki yıl gerektirir. Buna karşılık, doğal incilerin arzu edilen boyutlarda büyümesi uzun yıllar alır ve kültürlü kuzenlerinden 10 kat daha pahalı olabilir.
Denetlendiğinde, doğal incilerde, yavaş büyümenin neden olduğu soğan benzeri tabakalar bulunur. Kültür incileri, hızlı büyümeleri nedeniyle bu katmana sahip değildir. Kuyumcular, doğal incileri kültür incilerinden ayırt etmek için sıklıkla bu katman yokluğunu kullanır.
İnci çiftçileri, kuyumcular ve tüketiciler için doğal incilere kıyasla daha düşük maliyetle tutarlı kalite ve renkte toplu üretme yeteneğine sahiptir. Doğal inciler kuyumculuk endüstrisinde hala büyük prestij taşıyor, ancak fiyat etiketleri onları rahat tüketici pazarında daha az popüler hale getiriyor.