Japonya'nın en yüksek dağı olan Fuji Dağı, yaklaşık olarak son 100.000 yıl boyunca meydana gelen bir dizi volkanik patlamadan oluşuyordu. Bu aşamalar dağda bazalt ve andezit kaya tabakaları biriktirmiştir. Volkan hala aktiftir, en son patlama 1707'de meydana gelmiştir.
Fuji Dağı'nın en derin katmanları Komitake ve Ko-Fuji adı verilen birkaç eski volkan tarafından kuruldu. Bu volkanlar yaklaşık 10.000 yıl öncesine kadar aktifti. Altta yatan iki volkanın şekli, volkanın mevcut şeklinin düzensizliğine katkıda bulunur. Komitake ve Ko-Fuji, şu anda aktif olan volkandan büyük lav akışları ortaya çıkmaya başladığında etkisiz hale geldi. Yeni Fuji olarak bilinen bu volkan, eski volkanların üzerine büyük miktarda bazalt taşı koydu.
Patlamaların çoğu 3000 ila 4.500 yıl önce meydana geldi. Fuji'nin 1707'deki son patlaması tarihin en büyüğü idi ve volkanın zirvesinde gerçekleşti. Dağın yan kısımlarında 100'den fazla küçük konik volkan bulunur, ancak bunlar daha az etkindir. 2000 yılında başlayan Fuji Dağı'ndaki volkanın uyandığı ve tekrar patlamasıyla ilgili bir endişe vardı, ancak 21. yüzyıl patlaması henüz gerçekleşmedi.
