Ülkenin kuzeyinde bulunan başlıca Fransız limanları, Dunkerque ve Brest'i içerir. Batı Atlantik kıyısında, Bordo muhtemelen en önemlisidir. Akdeniz boyunca, baş limanlarda Fos-sur-Mer ve Marsilya bulunmaktadır. Diğer kritik limanlar ise Le Havre, Rouen, Nantes ve La Pallice'dir.
Bordeaux'nun ana limanı aynı zamanda Aquitaine Departmanı'nın başkentidir ve ülkenin en ünlü şarap üretim bölgelerinden birine erişim izni verir. Brest, Fransa'nın en önemli nakliye merkezlerinden birini temsil etmekte olup, neredeyse her türlü deniz tipi gemiyi barındırabilecek son derece iyi korunmuş bir limana sahiptir. Rouen limanı, Paris'ten sadece 100 kilometre uzaklıktaki Seine'de bulunur ve İkinci Dünya Savaşı'nın yıkılmasından sonra önemli bir sanayi kasabası olmak üzere başarıyla yeniden inşa edildi.
Marsilya, tüm Akdeniz'deki en büyük limanlardan biridir ve özellikle hareketli gemi yapımı, balıkçılık ve petrol arıtma endüstrilerine sahiptir. Dunkerque, petrokimya, çelik, petrol arıtma ve alüminyum üretimi gibi önemli sektörlere de ev sahipliği yapıyor. Aynı zamanda, 1940 yılında ünlü ve çaresiz olan Müttefik deniz tahliyesinin yapıldığı bölge. Le Havre, Fransa'nın Marsilya'dan sonra en büyük ikinci limanıdır ve kuzeyde Birleşik Krallık'ın Southampton sahiline sadece 106 kilometre uzaklıktadır. Bu yakınlık nedeniyle, Le Havre'nin en önemli endüstrilerinden biri İngiltere ve İrlanda'ya giden feribot trafiğini yönetiyor.
