Dünya Sağlık Örgütü verilerine göre Filipinler'deki bulaşıcı ilk 10 hastalık arasında tüberküloz, dang humması, zatürree, sıtma, ishal, bronşit, grip, akut ateşli hastalık, HIV ve alt solunum yolu enfeksiyonları bulunur. Filipinler’deki en önemli 10 morbidite sebebinin sekizi bulaşıcı hastalıklardı.
Tarihsel olarak, HIV, sıtma ve tüberküloz bulaşıcı hastalıklar arasında en fazla ölüme neden olmuştur. Tüberkülozun, ülkede kaybedilen yaşam yıllarının yüzde 9'unu oluşturduğu tahmin edilmektedir. Resmi olarak, Filipinler HIV için düşük riskli bir ülke olarak listelenmiştir ve nüfusun yüzde birinden azı HIV pozitifdir. Sıtma vakaları da son birkaç yılda azalmıştır.
