Elizabeth Proctor, Mary Warren tarafından 1692'de Salem Cadısı Davaları sırasında bir cadı olmakla suçlandı. O sırada hamileydi, bu yüzden atandığı zamanda idam edilmedi. Elizabeth'in bebeği doğduktan sonra cadı denemeleri bitmişti ve affedildi.
Salem Massachusetts Şehir Rehberine göre, Elizabeth Proctor 28 Mart 1692'de bir cadı olarak kınandı. 11 Nisan'da, Elizabeth ve Sarah Cloyce'nin mahkemede Vali Yardımcısı Thomas Danforth ve Kaptan Samuel de dahil olmak üzere çeşitli şehir yetkilileri tarafından mahkemeye alındığı zaman Sewall, her iki kadın da büyücülükle suçlandı ve hapsedildi.
Elizabeth Proctor, büyücülükten yargılanan ve kınandığı Ağustos ayının başına kadar Salem'de hapishanede kaldı. O gün mahkemede, Elizabeth'in kocası John da dahil olmak üzere diğer suçlanan cadılar, meşhur Gallows Tepesi'ne asıldı, ancak Elizabeth'e hamile kaldığı için geçici bir idam süresi verildi.
Elizabeth Proctor doğduğunda, Salem Cadı Davaları sona erdi. Elizabeth affedildi ve hapishaneden serbest bırakıldı. Ancak, yasaya göre, o hala mahkum bir suçlu idi. Bu, Elizabeth'in kocası John Proctor'ün mallarından herhangi birini talep etmesini engelledi. Bu yıllarca koştuğu aile lokali dahil. 1697'de, Cadı Davaları'ndan beş yıl sonra, bir mahkeme, Elizabeth Proctor'un çeyizini restore etti.
17 Aralık 1710’da Elizabeth Proctor’e kocası John’un ölümü için tazminat olarak 578 pound ve 12 şilin ödendi.