WebMD'ye göre CLA veya konjuge linoleik asidin en sık görülen yan etkileri mide, halsizlik, bulantı ve ishaldir. Takviyesi insülin direncini kötüleştirebilir, karaciğeri olumsuz yönde etkileyebilir, iyi kolesterol seviyelerini düşürebilir ve iltihaplanmayı artırabilir.
Birçok insan bu yağ asidini kilo verme yardımcısı olarak kabul eder, çünkü CLA'nın sentetik formlarının çalışmalarının vücut yağını azalttığı gösterilmiştir, Holly State Ohio Eyalet Üniversitesi'nden Araştırma İletişimi için yaptığı açıklama. Çalışmaların çoğu, CLA'nın vücut yağını azalttığını ve insanların yemekten sonra kendilerini daha iyi hissetmelerine yardımcı olurken, tipik olarak BMI veya kiloyu etkilememesini sağlar. Takviyeleri alan fareler üzerinde yapılan bir araştırma, CLA'nın diyabetiklerde vücut kütlesini ve kan şekeri seviyesini düşürdüğünü buldu. Fareler, karaciğerlerinde aşırı ve tehlikeli miktarda yağ geliştirmiş ve insülin direncinin artmasına neden olmuştur.
Ek olarak şizofreni de dahil olmak üzere bazı zihinsel bozukluklar için ilaçlarla etkileşime girebileceğinden, CLA almayı düşünen herhangi bir kişinin önce mevcut ilaçları ile olumsuz etkileşimlerden kaçınmak için doktorla konuşması gerekir. Konjuge linoleik asidin güvenliğine ilişkin kanıt bulunmadığından WebMD, hamile veya emziren kadınların bu eki almamasını önerir. Aynı zamanda çocuklar için ek önermez.