Babür İmparatorluğu’nun çöküşünün ana nedenleri, ağır vergilendirmenin yol açtığı ekonomik baskıların yanı sıra Hindular, Sihler, Rajputlar ve Marathalar gibi gruplara uygulanan dini ve politik hoşgörüsüzlük idi. adaletsizlikler Babür hükümdarlarının boyun eğdirdiği insanlar arasında isyanı artırdı. İran fatih Nadir Şah, Marathas ve İngiliz Doğu Hindistan Şirketi tarafından dışarıdan yapılan saldırılar da imparatorluğun ölümünü hızlandırdı.
Babur adında bir prens, 16. yüzyılın ortalarında kuzey Hindistan'ı fethetti. Timur ve Cengiz Han'dan geldiği için imparatorluğu, Moğol’un Pers tarzı olan Babür olarak tanındı. Torunu Akbar, Büyük Akbar olarak bilinen, imparatorluğu genişletti. Akbar'ın torunu Shah Jahan, Büyük Delhi Camii ve Tac Mahal'i inşa etti. Hükümdarlığı ve oğlu Aurangzeb'in hükümdarlığı altında, imparatorluk kültürel ve askeri zirvesine ulaştı, ancak imparatorluğun daha da genişlemesi onu iflasa yaklaştırdı ve isyan ve fetih imparatorluğu tehdit etti.
18. yüzyılın başlarında imparatorluk dağılmaya başladı. Marathas, kuzey Hindistan'ın çoğunu istila etti ve British East India Şirketi, Hindistan Raj'ının dönemini başlatmaya yardımcı olarak Hindistan'ın çoğunu siyasi kontrol altına aldı.