Alabama'daki başlıca su kaynaklarından bazıları Alabama Nehri, Tennessee Nehri, Tombigbee Nehri, Kara Savaşçı Nehri, Mobil Nehir, Cahaba Nehri, Coosa Nehri, Tallapoosa Nehri, Chattahoochee Nehri, Choctawhatchee Nehri, Conecuh Nehri , Mobile Bay ve Choctawhatchee Bay. Alabama'da doğal göl yok; ancak, çeşitli nehirleri üzerine kurulu baraj ve rezervuarlardan bazı yapay göller oluşturulmuştur.
Alabama'daki su sistemlerinin çoğu Meksika Körfezi'ne boşaldı. Mobil Nehir, Alabama Nehri ve Tombigbee Nehri'nin birleştiği yerde oluşur. Alabama'daki insan yapımı diğer göller Guntersville, West Point, Aliceville, Bear Creek, Bankhead ve Harding'dir.
