Tuvaletten çıkan su ve atıklar ya yerel bir septik sisteme ya da kanalizasyon sistemine aktıktan sonra gider. Yerel septik sistemler katı atıkları parçalara ayırır ve genellikle bir bahçedeki toprağa drenaj ederken, kanalizasyon sistemleri atıkları bir su arıtma tesisine taşır.
Yerel septik sistemi bulunmayan ev ve işyerleri, tuvaletten yerel atıklara maddi atık gönderir. Oradan atık su arıtma tesislerine akar. Kanalizasyon genellikle ilk önce büyük katı cisimlerin filtrelendiği bir ana iş yerinden geçer. Materyal atıkları çamura dönüştürülür ve tedavide daha sonraki bir noktada mikroplar tarafından parçalanır.
