Orta Doğu’nun en belirgin fiziksel özellikleri engin çölleridir, ancak bölge aynı zamanda dağlık alanlara, yüksek yaylalara ve hatta birkaç verimli nehir vadisine ev sahipliği yapmaktadır. Yeryüzündeki en alçak nokta, Ölü Deniz, deniz seviyesinden 1400 feet'in altında. Bölgenin doğu kısmındaki dağ sıraları, 15.000 feet'in üzerindeki zirvelerle, Himalayaların yüksek zirvelerine doğru yükseliyor.
Bölgenin büyük bir kısmı sıcak ve kurak çöl ovalarının egemen olduğu Ortadoğu nehirleri medeniyetler için önemli su kaynaklarıdır. Nil Nehri, eski Mısırlıların can damarı olarak hizmet etti ve düzenli sel ve geri çekilme döngüsü piramitler gibi büyük inşaat projelerinin gelişmesine yol açtı. Dicle ve Fırat Mezopotamya uygarlığını besledi ve günümüz Irak halkı için hala önemli nehirler.
Yüksek yaylalar ve dağ silsileleri de bölgenin önemli özellikleridir. Levant’ın yükselen toprağı, Akdeniz’in doğu sınırında, yerleşim için uygun yeşil ve bereketli bir toprak elde etmek için nemli deniz meltemlerinden su sızmasına yardımcı oldu. Türkiye'deki Toros Dağları, bölgeyi Asya'dan ayırır ve bu alanda yayılan medeniyetleri izole eder.
