Mıknatıslı mürekkep karakter tanıma sistemleri yüksek güvenlik seviyeleri sunar çünkü MICR karakterleri demir oksit mürekkebi kullanılarak yazılır ve sıkı bir formatta kalır; ancak, bu özel sistemler maliyetlidir ve yalnızca belirli biçimlerde yazılmış MICR yazı tiplerini okumak için kullanılabilir. MICR yazıcılarda kullanılan kartuşlar diğer toner kartuşlarına kıyasla daha maliyetlidir.
Manyetik mürekkep karakter tanımanın bir diğer önemli avantajı, küçük bir okuma hatası oranına sahip olmasıdır. MICR tarayıcılar, Amerikan Bankacılar Birliği, ABA ve Amerikan Ulusal Standartlar Enstitüsü ANSI tarafından belirlenen standartları takip ettiği sürece karakterleri tam olarak deşifre etmek için geliştirilmiştir.
Bu standartlar oldukça yüksektir ve bazı kurumlar için belirgin bir dezavantaj olabilen başarılması zor olabilir. ANSI tüm baskı standartlarını yönetir ve uygular; MICR yazı tipleri belirlenen standartları karşılamıyorsa, işleme hatalarına neden olacak ve bankalarda ve diğer kurumlarda reddedilecektir.
Manyetik mürekkep karakter tanıma teknolojisi çeklerin geçerliliğini doğrulamak için çoğunlukla bankalar tarafından kullanılır; bazı havayolları uçak biletlerini doğrulamak için bunları kullanır. Karakterler ve sayılar genellikle kontrollerin altında bulunur. MICR toner kullanan lazer yazıcılar, manyetik mürekkep karakterlerini yazdırmak için kullanılır.
