Kahverengi kuyu suyunun en yaygın nedeni demir kirliliğidir. Su rengindeki ani bir değişiklik, kirleticinin kuyuya yeni girdiği ve endüstriyel kirlenme, paslı su tesisatı nedeniyle oluşabileceği anlamına gelir. demirbaşlar veya doğal demirden toprak sızıntısı.
Demiri kuyu suyundan uzaklaştırmak için kimyasal arıtma ve sediment filtrasyonu kullanılır. Demir çıkarıldıktan sonra, su, kuyu suyunda bir biyofilm oluşmuş olabilecek demir tüketen bakterileri öldürmek için daha fazla kimyasal işlem gerektirmektedir. Demir kuyu suyunda kalırsa, bakteriler geri dönebilir ve nükseye neden olabilir.
