Kuyu suyunu arıtmanın bazı yolları bir filtreleme sistemi veya su yumuşatıcıları kullanmayı içerir. Kuyu suyunu arıtmanın diğer yolları, dezenfekte etmeyi veya damıtmayı içerir.
Kuyu suyunun filtrelenmesi, fiziksel, biyolojik veya kimyasal olabilen bir bariyer kullanarak bloke edilerek safsızlıklarını giderir. Su yumuşatıcılar, kalsiyum ve magnezyum iyonları dahil olmak üzere suyu sertleştiren parçacıkları, potasyum ve sodyum gibi yumuşatıcı maddelerle değiştirerek uzaklaştırır. Damıtma, suyu buhara dönüştürür ve ayrı bir bölmede toplar ve önceki bölmede kirleri bırakır. Suyu dezenfekte etmek için yaygın olarak kullanılan bazı kimyasallar arasında klor, ozon ve klor dioksit bulunur.
