Jüpiter ile Zeus arasındaki fark kökenlerinde yatmaktadır. Zeus, Yunan mitolojisinde, Jüpiter ise Roma mitolojisindedir. Çok sayıda benzerlikleri var, ancak Jüpiter'in Zeus'tan ilham almış olması muhtemeldir.
Zeus ve Jüpiter birbirleriyle eşdeğerdir ancak farklı eski uygarlıklardan gelmektedir. Yunan mitolojisinden Zeus, tanrıların kralı ve gökyüzünün hakimidir. Genellikle şimşek çakmak ve egemen fırtınalar olarak tasvir edilir. Eski Roma mitolojisindeki Jüpiter de aynı şekilde tasvir edilip anlatılıyor. Her ikisi de kız kardeşleriyle evlidir ve her ikisi de kendi mitolojiler dallarında oluşturulan tanrılar kümesinin kralıdır.
Zeus genellikle daha popülerdir ve hala modern Jüpiter'le karşılaştırılabilir olmasına rağmen, günümüz Hıristiyanlarının çoğunun inandığı tanrı ile birçok bağlantıya sahiptir. Örneğin, İsa Mesih'in doğum hikayesinde, Bakire Meryem, kutsal ruh tarafından emdirilir. Birçok Yunan hikayesinde, Zeus bir baki kızı emer ve çocuk harika şeyler yapmak için büyür ve sonunda bir kahraman olur. Hem Jüpiter hem de Zeus, insan ırkı ile çok kişisel ilişkilere sahip olarak tasvir edilmiştir ve her ikisi de insanlığı yok eden efsanevi sellere bağlıdır.
