Kuzey Japonya, kuzey Japonya serin bir ılıman iklime sahipken, güney Japonya da tropikal olarak sınıflandırıldığından, ülkenin bulunduğu yere bağlı olarak farklı bir iklimi vardır. Sapporo gibi şehirlerde kışın donma sıcaklıklarının sadece altına düşüyor. Haziran ayında yaz ayları ılıman sıcaklıklarda başlar, Fukuoka ve Naha gibi şehirler 80'lerde ortalamaları görür.
Japonya’nın kuzey bölgesi kış sporlarına ev sahipliği yapmakla tanınır ve iyi yağış seviyelerini görür, güney Japonya ise kışın çoğu için ılık ve güneşli kalır. Japonya'da yağışlı mevsim, haziran ayında başlayarak yaklaşık 3 ila 4 hafta sürer.