Japonya, kuzeyden güneye, bir dizi adadan oluşan 3.000 kilometre boyunca uzanıyor.
Japonya'nın çoğunluğu dağlık olup, ovaları ve havzaları kalan alanı oluşturmaktadır. Dört ana adası Honshu, Hokkaido, Kyushu ve Şikoku ve başkenti Tokyo'dur. Japonya, denizle çevrili olduğu için farklı bir deniz ekosistemini sürdürüyor. Japonya'nın bir başka özelliği de uzak kuzey ve güneydeki aşırı sıcaklıklar. Örnek olarak, Mart ayında Japonya'da insanlar kuzeyde kayak yapabilir ve güneyde güneşlenebilirler.
