Bir havuz astarı bir çamaşır suyu ve su çözeltisiyle veya kabartma tozu kullanılarak temizlenebilir. Lekeleri önlemek için doğru su kimyasının korunması da önemlidir.
Havuz astarının düzgün şekilde temizlenmesi, lekenin nedenini bilmeyi gerektirir. Lekeler yeşil veya kahverengi ise, büyük olasılıkla yosun veya diğer bitki maddeleri gibi organik maddelerden kaynaklanır. Kırmızımsı kahverengi renkler muhtemelen lekenin pastan kaynaklandığı anlamına gelir.
Havuzun su kimyasının düzeltilmesi, astarın çıkarılması veya sert bir ovma yapılması gerekmeden organik lekeleri çıkarabilir. PH seviyesi 7,2 ile 7,6 arasında ve klor seviyesi 1,5 ile 2,5 arasında olmalıdır. Kalsiyum sertlik seviyeleri milyonda 200 ila 300 parça, alkalilik seviyeleri milyonda 80 ila 100 parça olmalıdır. Bu seviyeler dengesiz olduğunda, havuz yosun veya diğer organizmaların büyümesi için ideal bir nokta olabilir. Skimmer kutusunun ve diğer sorunlu alanların kabartma tozu ile kaplı bir bez ile temizlenmesi sadece bazı lekeleri gidermekle kalmaz, aynı zamanda havuzdaki pH ve alkalin seviyelerini de yükseltir.
Sudaki kimyasal seviyelerin düzeltilmesiyle giderilemeyen lekeler, bir kısım ağartıcıdan ve iki kısım sudan yapılan bir ağartma çözeltisi ile çıkarılmalıdır. Havuzun boşaltılması ve astarın çıkarılması, çözeltinin etkili olması için gereklidir. Solüsyon astara uygulanmalı ve durulamadan önce bir saat bekletilmelidir. Ek fırçalama gerekebilir. Sert lekeleri çıkarmak için işlem gerektiğinde tekrarlanır.