Domuz gübresi bitkiler için iyi bir gübre olabilir. Ancak, insanlarda gıda kaynaklı hastalığa neden olan patojenlerin riski nedeniyle, uzmanlar sebze bahçelerini döllemek için domuz gübresi kullanılmasını önermemektedir.
Domuz gübresi, E. coli, salmonella ve listeria gibi zararlı bakteriler içerebilir. Bu patojenler, insanlara gübre ve taze meyve ve sebzelerle doğrudan temas yoluyla geçebilir. Gübre 140 derece veya daha yüksek bir sıcaklıkta kompoze edilerek ve meyve veya sebze toplanmadan en az 120 gün önce toprağa gübre uygulanarak kirlenme riski azaltılabilir; Bununla birlikte, uzmanlar domuz gübresinin bu tür ihtiyati önlemlerle hayatta kalan diğer gübre türlerine göre daha yüksek patojen riski taşıdığı konusunda uyarıyorlar.