Modern atom teorisi, tüm maddelerin atom denilen küçük parçacıklardan oluştuğu bir teoridir. Bu teori, tüm maddelerin davranışını açıklamak için fizik ve kimyada kullanılır.
Modern atom teorisi, filozofların maddenin tek ve bölünmez bir bölüme ulaşana kadar bölünebileceğini teorik hale getirdiği antik Yunanistan'a dayanır. 19. yüzyılda, fizikçiler ve kimyagerler atomun varlığına dair daha fazla kanıt bulmaya başladıkları için, bu kavram ana düşünceye getirildi. Başlangıçta, J.J.'ye kadar atomun en küçük parçacık olduğu düşünülüyordu. Thomson 1897'de elektronu keşfetti. Bugün teori, atomu ve tüm maddeyi oluşturan birçok küçük parçacığı içerecek şekilde büyüdü.