Çiçekli kiraz ağaçları, kahverengi çürüme (çiçek yanıkları da denir), kara düğüm ve Eutypa dieback gibi birçok mantar hastalığına karşı hassastır. Bir ağaca bir mantar bulaştığında, tedavisi yoktur. Hasar görmüş uzuvlar dikkatlice bahçeden uzaklaştırılmalı ve atılmalıdır. Bu yaygın mantar hastalıkları, çiçekli bir kiraz ağacına ciddi hasar verebilir veya öldürebilir.
Kahverengi çürüme, baharda solmaya başladıkları gibi kiraz ağacının çiçeklerini etkiler. İlk önce çiçeklerin üzerinde küçük siyah noktalar olarak belirir ve uzuvlara yayılır, uzuvları gövdeye doğru iter. Kahverengi çürüme ile enfekte olan uzuvlar, enfeksiyondan en az 8 inç geri alınmalıdır. Kara düğüm de ilkbaharda yayılır. İlkbaharın sıcaklığı ve nemi serbest bırakıp sporları dağıtana kadar ağaçlardaki budakların içine doğru süzülür. Ağaçlarda ilk önce yavaşça yeşile dönen, sonra siyah olan mantar düğümleri olarak görünür. Siyah düğüm enfeksiyonu, bir ağacın dolaşım sistemine müdahale ederek uzuvların solmasına ve ölmesine neden olur. Düğümlü dallar, kış ve erken ilkbaharda, düğümün en az 3 inç altında uzakta budanmalıdır.
Mantar Eutypa lata, ilkbahar ve yaz sonunda kiraz ağacının geri dönmesine neden olur. Budama kesiği alanlardan su damlacıklarına ağaca girerek uzuvların aniden solmasına ve ölmesine neden olur. Solmuş uzuvlar enfeksiyondan en az bir ayak geri budamalıdır. Tüm mantar enfeksiyonlarında, budama ekipmanının yayılmasını önlemek için her kesim arasında ve ağaçlar arasında dezenfekte edilmesi gerekir. Mantar ilaçları erken ilkbaharda kullanılırsa enfeksiyonun önlenmesine yardımcı olabilir.
