Bir geyik faresi, uzun, üçgen burunlu ve iri siyah gözleriyle tanımlanabilir. Geyik faresi genellikle kahverengi renktedir, sıradan bir ev faresi genellikle gri renktedir.
Geyik farenin üstü kahverengi ila kırmızımsı arasındadır ve farenin göbeği beyazdır. Geyik farede, seyrek kürklü, büyük, yuvarlak kulaklar vardır. Geyik farelerde üstte kırmızımsı veya kahverengi, altta beyaz renkte uzun kuyruklar vardır. Yaygın fareler koyu renkli, tüysüz bir kuyruğa sahiptir ve tipik olarak tekdüzedir. Geyik fareleri, farenin yaşadığı bölgeye bağlı olarak kırmızımsı veya kahverengi yerine gri ve beyaz da olabilir. Hem gri hem de kahverengi geyik farelerde beyaz bir karın altı ve iki renkli kuyruk bulunur.
Olgun ev fareleri geyik farelerden daha büyüktür. Olgun bir geyik faresinin tipik boyutu, kuyruk dahil olmak üzere yaklaşık 4 inç veya 7 inçtir. Yaygın bir fare 8 inç uzunluğa ulaşır.
Geyik farelerinin arka ayakları genellikle sıradan ev farelerinden daha küçüktür. Ek olarak, geyik farelerdeki renklerin ayrılması keskin bir şekilde fark edilirken, sıradan bir fare yavaş yavaş birbirine karışan renklere sahiptir. Geyik fareleri ve ev fareleri arasındaki renk farklılıkları kuyrukları incelerken özellikle belirgindir.
